Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Spta1P08032 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Spta1P08032 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms