Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
TtrP07309 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
TtrP07309 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
TtrP07309 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
TtrP07309 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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