Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SparcP07214 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SparcP07214 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SparcP07214 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SparcP07214 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SparcP07214 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SparcP07214 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SparcP07214 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SparcP07214 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SparcP07214 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SparcP07214 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SparcP07214 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SparcP07214 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SparcP07214 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SparcP07214 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SparcP07214 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms