Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Krt1P04104 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Krt1P04104 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms