Protein–RNA interactions for Protein: P01809

Ig heavy chain V region X24, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01809 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01809 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01809 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01809 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01809 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01809 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01809 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms