Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01657 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01657 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01657 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01657 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01657 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01657 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01657 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01657 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01657 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01657 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms