Protein–RNA interactions for Protein: P01654

Ig kappa chain V-III region PC 2880/PC 1229, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01654 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01654 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01654 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01654 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01654 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01654 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01654 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01654 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01654 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01654 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01654 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01654 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms