Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01645 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P01645 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P01645 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P01645 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01645 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01645 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01645 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01645 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms