Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01641 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01641 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01641 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P01641 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P01641 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P01641 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms