Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01638 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01638 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01638 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01638 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01638 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms