Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
P01636 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01636 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01636 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01636 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01636 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01636 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P01636 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
P01636 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
P01636 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
P01636 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
P01636 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01636 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01636 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
P01636 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01636 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
P01636 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms