Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ifnb1P01575 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ifnb1P01575 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms