Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp1O89090 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sp1O89090 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms