Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tcn2O88968 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tcn2O88968 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms