Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apaf1O88879 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apaf1O88879 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms