Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
F11rO88792 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
F11rO88792 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
F11rO88792 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
F11rO88792 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms