Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tom1O88746 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tom1O88746 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tom1O88746 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tom1O88746 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms