Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
BlmO88700 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BlmO88700 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BlmO88700 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
BlmO88700 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BlmO88700 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
BlmO88700 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BlmO88700 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BlmO88700 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BlmO88700 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BlmO88700 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BlmO88700 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
BlmO88700 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
BlmO88700 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
BlmO88700 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
BlmO88700 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
BlmO88700 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BlmO88700 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
BlmO88700 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
BlmO88700 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms