Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Capns1O88456 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Capns1O88456 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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