Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AurkcO88445 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
AurkcO88445 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AurkcO88445 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms