Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnnt1O88346 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnnt1O88346 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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