Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctnnal1O88327 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ctnnal1O88327 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms