Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CaskO70589 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CaskO70589 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CaskO70589 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CaskO70589 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CaskO70589 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CaskO70589 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CaskO70589 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CaskO70589 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CaskO70589 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CaskO70589 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CaskO70589 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CaskO70589 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CaskO70589 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CaskO70589 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CaskO70589 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms