Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CtssO70370 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CtssO70370 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CtssO70370 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CtssO70370 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtssO70370 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtssO70370 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CtssO70370 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CtssO70370 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CtssO70370 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms