Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Lnx1O70263 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Lnx1O70263 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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