Protein–RNA interactions for Protein: O70126

Aurkb, Aurora kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkbO70126 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
AurkbO70126 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
AurkbO70126 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms