Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ChkbO55229 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChkbO55229 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ChkbO55229 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ChkbO55229 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ChkbO55229 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms