Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tlx3O55144 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Tlx3O55144 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms