Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Atp2a2O55143 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Atp2a2O55143 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms