Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Dsg2O55111 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dsg2O55111 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms