Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PrxO55103 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PrxO55103 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PrxO55103 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PrxO55103 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PrxO55103 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PrxO55103 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrxO55103 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrxO55103 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PrxO55103 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PrxO55103 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms