Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BckdkO55028 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
BckdkO55028 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BckdkO55028 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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