Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf13O54965 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms