Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sema6bO54951 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sema6bO54951 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms