Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NlkO54949 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NlkO54949 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NlkO54949 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NlkO54949 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NlkO54949 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NlkO54949 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NlkO54949 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NlkO54949 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NlkO54949 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NlkO54949 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
NlkO54949 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
NlkO54949 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms