Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Socs5O54928 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Socs5O54928 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Socs5O54928 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Socs5O54928 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Socs5O54928 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Socs5O54928 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Socs5O54928 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Socs5O54928 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms