Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TsksO54887 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TsksO54887 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TsksO54887 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TsksO54887 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TsksO54887 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TsksO54887 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TsksO54887 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TsksO54887 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsksO54887 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsksO54887 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsksO54887 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsksO54887 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsksO54887 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsksO54887 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TsksO54887 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TsksO54887 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TsksO54887 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsksO54887 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TsksO54887 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsksO54887 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsksO54887 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsksO54887 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TsksO54887 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms