Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Csnk2a2O54833 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Csnk2a2O54833 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms