Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DffaO54786 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DffaO54786 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DffaO54786 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DffaO54786 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DffaO54786 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DffaO54786 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DffaO54786 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DffaO54786 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DffaO54786 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DffaO54786 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms