Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
EdaO54693 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
EdaO54693 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
EdaO54693 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
EdaO54693 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms