Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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Timm44O35857 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Timm44O35857 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Timm44O35857 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Timm44O35857 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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Timm44O35857 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Timm44O35857 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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