Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ppfibp2O35711 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ppfibp2O35711 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms