Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NudcO35685 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NudcO35685 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NudcO35685 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NudcO35685 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NudcO35685 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NudcO35685 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NudcO35685 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms