Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Slc1a6O35544 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Slc1a6O35544 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms