Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Sema6aO35464 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Sema6aO35464 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms