Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Atf6bO35451 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atf6bO35451 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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