Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rnf5O35445 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf5O35445 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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