Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
H2-ObO35424 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H2-ObO35424 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms