Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Kpna3O35344 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kpna3O35344 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms