Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kpna4O35343 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Kpna4O35343 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms